Hipoteka może być stosowana w postępowaniu karnym albo jako środek zabezpieczający wykonanie przyszłego wyroku skazującego, albo jako poręczenie majątkowe.
Hipoteki tego typu zachowują swój cywilistyczny charakter, a ich źródłem jest postanowienie prokuratora. Pomimo wskazanych podobieństw, obie hipoteki znacznie więcej różni, choćby podstawa wpisu do księgi wieczystej.
Podobieństwa i różnice hipotek w postępowaniu karnym, a także ich konsekwencje na gruncie postępowania wieczystoksięgowego omówiła r.pr. Elżbieta Jóźwiak na łamach prawo.pl w artykule „Postanowienie prokuratora może być podstawą wpisu hipoteki”.